微生物肥料是以微生物的生命活动导致作物得到特定肥料效应的一种制品，是农业生产中使用肥料的一种。它对农作物成长以及土壤营养有着巨大的用作。

　　首先，可降低农民生产成本、提高作物产量，增加农民收入。适用于大田作物大面积推广的复合微生物肥料等系列品种，其生产成本与普通肥料相当或稍高，在玉米、水稻、小麦、花生等作物的大量实验与示范的结果表明，微生物肥料在减少用量1/3到1/2的情况下，仍有增产效果，这样农民在不增加化肥使用成本的情况下，施用这种微生物肥料可获得更高的产量，而且省工省时，使用方便，可获得更大效益，带动粮食、蔬菜、果品、以及其他经济作物的大面积增产，解决粮食安全，食品健康等重大问题。

　　其次，节能减排效果显著。微生物肥料具有解磷、解钾、固氮的作用，可提高肥料利用率10%～30%以上。这种肥料的大量生产和推广使用，可以节约肥料资源以及与之相关的煤炭、天然气、石油等资源，对缓解能源危机有一定的帮助。

　　再者，可以改善农产品品质。随着人民生活水平的不断提高，尤其是人们对生活质量提高的要求， 都在积极发展绿色农业来生产安全、无公害的绿色食品。生产绿色食品过程中要求不用或尽量少用(或限量使用)化学肥料、化学农药和其它化学物质。它要求肥料必须首先保护和促进施用对象生长和提高品质;其次不造成施用对象产生和积累有害物质;三是对生态环境无不良影响。微生物肥料基本符合以上三原则，不但能缓和或减少农产品污染，而且能够改善农产品的品质。

　　 ，改良土壤作用。微生物肥料中有益微生物能产生糖类物质，占土壤有机质的0.1%，与植物粘液，矿物胚体和有机胶体结合在一起，可以改善土壤团粒结构，增强土壤的物理性能和减少土壤颗粒的损失，在一定的条件下，还能参与腐殖质形成。所以施用有机肥生产线生产的微生物肥料能改善土壤物理性状，有利于提高土壤肥力。